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158. A gradient of difficulty

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ゲストにまいんさんを迎え、共通テスト生物(2023)を解いてみての感想と解説、そしてどのような力が問われているのかについて議論しました。

Shownotes

  • 157. Litmus milk (Researchat.fm) … “ゲストにまいんさんを迎え、共通テストの特徴、共通テスト生物基礎(2023)を解いてみての感想と解説、そしてどのような力が問われているのかについて議論しました。”
  • まいんさん
  • 2023年度大学入学共通テスト 生物基礎
  • 2023年度大学入学共通テスト 生物
  • 2023年度大学入学共通テスト 追試
  • あいまいまいんの生物学 … まいん先生のブログ
  • 2023年度大学入試共通テスト 生物基礎 所感 (あいまいまいんの生物学) … まいん先生による生物基礎解説
  • ぷらんちゅ … “植物を同定して進める恋愛ゲームです!” 是非プレイしてください。
  • ぷらんちゅの配信 by Researchat.fm … “分子生物学者がプレイする「植物同定恋愛ゲーム ぷらんちゅ」ぷらんちゅの作成者のまいんさんをお呼びし、ポッドキャスト番組Researchat.fmのメンバーで実況プレイしました。” YouTubeフォローしてください…
  • 中間集計(最高得点に関する話)
  • 得点調整について
  • オペロン
  • ジャコブとモノー … オペロン説の提唱により、1965年のノーベル生理学・医学賞を共同受賞
  • A Genetic Switch … 転写制御の第一人者であるMark Ptashneが書いた本。1st Editionが良いと聞く。結構薄くて大学で初めてちゃんと読み切った洋書。
  • ラクトースオペロン
  • アラビノースオペロン
  • RNA polymerase II … 「真核生物」で一般的な転写に用いられているRNA polymerase。他にもIとIIIがある。原核生物では一個しかないのでそもそも数に反応してしまった私が悪い…すぐ真核で考えちゃう…
  • 細胞核
  • overexpression … 過剰に発現
  • シャジクモ
  • 二次共生
  • マトリョーシカ … 関係ないけれどもマトリョーシカの起源が日本にある問題って本当なの? “19世紀末、神奈川県箱根町にあったロシア正教会の避暑館にやってきたロシア人修道士が、本国への土産に持ち帰った箱根細工の七福神の入れ子人形がマトリョーシカの元になったという説。”
  • 葉緑体から描ける系統樹と核ゲノムから描く系統樹の違い … Suisetzさんから拝借させていただきました。
  • 盗タンパク質
  • Manabu Bessho-Uehara先生 … すいません!BeppuではなくBesshoさんです…
  • さすがにミトコンドリアと真核生物の系統を見るに、シアノバクテリアが共生して葉緑体になる段階では真核細胞になっていたというべきか… ただそのプロセスは結構気になる。ミトコンドリアと葉緑体間におけるgene transferとかも起こっているのかな?(学生の時に調べた気はする….(要調査)
  • とにかく、現存の真核細胞の祖先は一つであり、そこにはミトコンドリアがあったはずであることは、強調しておく必要がある(と主張してもいいよね?)
  • LECA … LECA(The last eukaryotic common ancestor)の議論… ちょっと全然追えてないです…
  • LECAとFECA … 元気な時にでも読みます…
  • eukaryote = archea + bacteria説もまだ一説(だよね?)(要調査)
  • Garg and Martin. GBE (2016) … “Mitochondria, the Cell Cycle, and the Origin of Sex via a Syncytial Eukaryote Common Ancestor” tadasuが最近面白いと思っているmitosis, meiosis, mitchondria, sexの進化についての考察。meiosisはmitosisよりも起源が古いのか。mitochondriaはmeiosis, sexの誕生に必要なのか、それともvice versa。
  • 接合 … eukaryoteだとmating, bacteriaだとbacterrial conjugationかな。アーキアはわからん…(要調査)
  • アーキアだとcell fusionしてrecombinationする例はあるらしいが、どのくらいまでやるの???もちろんRecAホモログはあるわけだが、染色体全体での相同組換えはしないよね?(要調査)
  • sex … 基本的には配偶子がfusion(mating)して相同染色体間組換えを行うシステムを持つことをsexと言っていいようだが、もう少し調べていく必要がある。(要調査)
  • a/alphaは酵母とかの真核生物で使われる。バクテリアだとF+, F-とかのイメージだが他にも色々あるのだろうか。
  • Meselsonの動画 … 最高の動画。Meselson and Stahlの実験から、mRNA、制限酵素の発見、そして政治の話まで幅広いインタビュー。インタビューをしているのは上で書いたGenetic Switchの著者であるMark Ptashne。現在は性やgene conversionについて興味あるっていってます。
  • Laine, Sackton, Meselson. Genetics (2022) … “Genomic signature of sexual reproduction in the bdelloid rotifer Macrotrachella quadricornifera” Meselsonの最新論文。Bdelloid rotifers(ヒルガタワムシの仲間)は長年無性であると考えられてきたがどのようにしてその種を保ち続けているのか。
  • 赤の女王仮説
  • Muller’s rachet … マラーだね。
  • ノドジロオマキザル … Cebus capucinus, 新世界ザル
  • X inactivation
  • 48. XXXXXYYYYY(Researchat.fm) … “レベルEのサキ王女編からスタートし、アメフラシ、ボネリムシ 、半倍数性、ヴォルバキアによる破壊、ゾウリムシ、カモノハシ、オスの三毛猫など、真核生物における多様な性決定システムと性染色体について話しました。”
  • 遺伝子重複 … 遺伝子重複自体はかなり古くからアイデアがあったらしいがOhno (1970)で有名になった、とのことらしい。(要調査)
  • 犬と色覚 … モノクロではなく二色?
  • 遺伝子座
  • 対立遺伝子
  • gene drive
  • 遺伝的浮動(genetic drift)
  • 嗅球
  • ROS
  • アクチン
  • 母性・父性遺伝 … ミトコンドリアの母性遺伝を思い浮かべるんだけれども今回のような母性因子の遺伝に関してはちょっと枠組みが違うかも。
  • 多湖輝 … リサチャリスナーなら必読の頭の体操の筆者。頭の体操の中で作者が試験官をしたテストを読みだけで解いていく話が掲載されている。受験テクニックではない笑
  • 頭の体操 … え?読んだことない?今すぐ読みなさい。
  • プルテウス幼生
  • 解いた時のテクスチャ … 何????笑
  • 大学入試数学 不朽の名問100 大人のための“数学腕試し” (ブルーバックス) … 鈴木貫太郎先生のブルーバックスの本。円周率のあれとかああいうのが載ってる本。1/3ぐらいは解いた(T)。楽しい問題が多い。
  • ピーター・フランクルの中学生でも分かる大学生にも解けない数学問題集 … ピーターフランクル先生の本。一問目が中学生の時に解けず、いまだに一問目でスタックしております(15年以上経過)。昔の本は平太通信みたいなのが載っていて、そこに載っていた生物学者になったけれども早逝された研究者の方の話が記憶に残っている。なお問題はまだ解けないし、なんなら本はボストンに持ってきている。なお解けない(T)。
  • 数学オリンピック問題にみる現代数学 … これの生物オリンピック版頼む!素数が無限にあることを証明せよ、みたいな問題だけ覚えている。
  • 生物新・考える問題100選 (駿台受験シリーズ) … 新じゃないやつを解いていた記憶
  • まいん先生とたどる伝説の大学入試問題100選、まいん先生とたどる生物オリンピックにみる現代分子細胞生物学、出版希望
  • むしろ海外大学入試の伝説の一問とかみたい。北京大学2023とか。

Editorial Notes

  • 2日連続で共通テストのアツい気持ちをtadasuさんとシェアできて楽しかったです!もし皆さんのイチオシシビれ問題があればぜひ教えてください。お待ちしております。(まいん)
  • 頭パンパンでした。後半の疲れっぷりがひどい!体力つけなければ…まいん先生、ありがとうございました。あと、さっといろいろと疑問を振られた際あまりうまく答えられなかったので特に進化周りやsex周りは自分の中でちゃんともう一度組み立てておく必要があるなと感じました。アーキア周りも全然わからん。あやふやになっているままのところが非常によくわかったのでそう言う意味ではいい問題だなと思いました。シンプルゆえに強い。まいん先生の問題集きぼんぬ。ああ、そういえばあゆのモノマネするの忘れてた。(tadasu)
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Shownotes

  • 157. Litmus milk (Researchat.fm) … “ゲストにまいんさんを迎え、共通テストの特徴、共通テスト生物基礎(2023)を解いてみての感想と解説、そしてどのような力が問われているのかについて議論しました。”
  • まいんさん
  • 2023年度大学入学共通テスト 生物基礎
  • 2023年度大学入学共通テスト 生物
  • 2023年度大学入学共通テスト 追試
  • あいまいまいんの生物学 … まいん先生のブログ
  • 2023年度大学入試共通テスト 生物基礎 所感 (あいまいまいんの生物学) … まいん先生による生物基礎解説
  • ぷらんちゅ … “植物を同定して進める恋愛ゲームです!” 是非プレイしてください。
  • ぷらんちゅの配信 by Researchat.fm … “分子生物学者がプレイする「植物同定恋愛ゲーム ぷらんちゅ」ぷらんちゅの作成者のまいんさんをお呼びし、ポッドキャスト番組Researchat.fmのメンバーで実況プレイしました。” YouTubeフォローしてください…
  • 中間集計(最高得点に関する話)
  • 得点調整について
  • オペロン
  • ジャコブとモノー … オペロン説の提唱により、1965年のノーベル生理学・医学賞を共同受賞
  • A Genetic Switch … 転写制御の第一人者であるMark Ptashneが書いた本。1st Editionが良いと聞く。結構薄くて大学で初めてちゃんと読み切った洋書。
  • ラクトースオペロン
  • アラビノースオペロン
  • RNA polymerase II … 「真核生物」で一般的な転写に用いられているRNA polymerase。他にもIとIIIがある。原核生物では一個しかないのでそもそも数に反応してしまった私が悪い…すぐ真核で考えちゃう…
  • 細胞核
  • overexpression … 過剰に発現
  • シャジクモ
  • 二次共生
  • マトリョーシカ … 関係ないけれどもマトリョーシカの起源が日本にある問題って本当なの? “19世紀末、神奈川県箱根町にあったロシア正教会の避暑館にやってきたロシア人修道士が、本国への土産に持ち帰った箱根細工の七福神の入れ子人形がマトリョーシカの元になったという説。”
  • 葉緑体から描ける系統樹と核ゲノムから描く系統樹の違い … Suisetzさんから拝借させていただきました。
  • 盗タンパク質
  • Manabu Bessho-Uehara先生 … すいません!BeppuではなくBesshoさんです…
  • さすがにミトコンドリアと真核生物の系統を見るに、シアノバクテリアが共生して葉緑体になる段階では真核細胞になっていたというべきか… ただそのプロセスは結構気になる。ミトコンドリアと葉緑体間におけるgene transferとかも起こっているのかな?(学生の時に調べた気はする….(要調査)
  • とにかく、現存の真核細胞の祖先は一つであり、そこにはミトコンドリアがあったはずであることは、強調しておく必要がある(と主張してもいいよね?)
  • LECA … LECA(The last eukaryotic common ancestor)の議論… ちょっと全然追えてないです…
  • LECAとFECA … 元気な時にでも読みます…
  • eukaryote = archea + bacteria説もまだ一説(だよね?)(要調査)
  • Garg and Martin. GBE (2016) … “Mitochondria, the Cell Cycle, and the Origin of Sex via a Syncytial Eukaryote Common Ancestor” tadasuが最近面白いと思っているmitosis, meiosis, mitchondria, sexの進化についての考察。meiosisはmitosisよりも起源が古いのか。mitochondriaはmeiosis, sexの誕生に必要なのか、それともvice versa。
  • 接合 … eukaryoteだとmating, bacteriaだとbacterrial conjugationかな。アーキアはわからん…(要調査)
  • アーキアだとcell fusionしてrecombinationする例はあるらしいが、どのくらいまでやるの???もちろんRecAホモログはあるわけだが、染色体全体での相同組換えはしないよね?(要調査)
  • sex … 基本的には配偶子がfusion(mating)して相同染色体間組換えを行うシステムを持つことをsexと言っていいようだが、もう少し調べていく必要がある。(要調査)
  • a/alphaは酵母とかの真核生物で使われる。バクテリアだとF+, F-とかのイメージだが他にも色々あるのだろうか。
  • Meselsonの動画 … 最高の動画。Meselson and Stahlの実験から、mRNA、制限酵素の発見、そして政治の話まで幅広いインタビュー。インタビューをしているのは上で書いたGenetic Switchの著者であるMark Ptashne。現在は性やgene conversionについて興味あるっていってます。
  • Laine, Sackton, Meselson. Genetics (2022) … “Genomic signature of sexual reproduction in the bdelloid rotifer Macrotrachella quadricornifera” Meselsonの最新論文。Bdelloid rotifers(ヒルガタワムシの仲間)は長年無性であると考えられてきたがどのようにしてその種を保ち続けているのか。
  • 赤の女王仮説
  • Muller’s rachet … マラーだね。
  • ノドジロオマキザル … Cebus capucinus, 新世界ザル
  • X inactivation
  • 48. XXXXXYYYYY(Researchat.fm) … “レベルEのサキ王女編からスタートし、アメフラシ、ボネリムシ 、半倍数性、ヴォルバキアによる破壊、ゾウリムシ、カモノハシ、オスの三毛猫など、真核生物における多様な性決定システムと性染色体について話しました。”
  • 遺伝子重複 … 遺伝子重複自体はかなり古くからアイデアがあったらしいがOhno (1970)で有名になった、とのことらしい。(要調査)
  • 犬と色覚 … モノクロではなく二色?
  • 遺伝子座
  • 対立遺伝子
  • gene drive
  • 遺伝的浮動(genetic drift)
  • 嗅球
  • ROS
  • アクチン
  • 母性・父性遺伝 … ミトコンドリアの母性遺伝を思い浮かべるんだけれども今回のような母性因子の遺伝に関してはちょっと枠組みが違うかも。
  • 多湖輝 … リサチャリスナーなら必読の頭の体操の筆者。頭の体操の中で作者が試験官をしたテストを読みだけで解いていく話が掲載されている。受験テクニックではない笑
  • 頭の体操 … え?読んだことない?今すぐ読みなさい。
  • プルテウス幼生
  • 解いた時のテクスチャ … 何????笑
  • 大学入試数学 不朽の名問100 大人のための“数学腕試し” (ブルーバックス) … 鈴木貫太郎先生のブルーバックスの本。円周率のあれとかああいうのが載ってる本。1/3ぐらいは解いた(T)。楽しい問題が多い。
  • ピーター・フランクルの中学生でも分かる大学生にも解けない数学問題集 … ピーターフランクル先生の本。一問目が中学生の時に解けず、いまだに一問目でスタックしております(15年以上経過)。昔の本は平太通信みたいなのが載っていて、そこに載っていた生物学者になったけれども早逝された研究者の方の話が記憶に残っている。なお問題はまだ解けないし、なんなら本はボストンに持ってきている。なお解けない(T)。
  • 数学オリンピック問題にみる現代数学 … これの生物オリンピック版頼む!素数が無限にあることを証明せよ、みたいな問題だけ覚えている。
  • 生物新・考える問題100選 (駿台受験シリーズ) … 新じゃないやつを解いていた記憶
  • まいん先生とたどる伝説の大学入試問題100選、まいん先生とたどる生物オリンピックにみる現代分子細胞生物学、出版希望
  • むしろ海外大学入試の伝説の一問とかみたい。北京大学2023とか。

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  • 2日連続で共通テストのアツい気持ちをtadasuさんとシェアできて楽しかったです!もし皆さんのイチオシシビれ問題があればぜひ教えてください。お待ちしております。(まいん)
  • 頭パンパンでした。後半の疲れっぷりがひどい!体力つけなければ…まいん先生、ありがとうございました。あと、さっといろいろと疑問を振られた際あまりうまく答えられなかったので特に進化周りやsex周りは自分の中でちゃんともう一度組み立てておく必要があるなと感じました。アーキア周りも全然わからん。あやふやになっているままのところが非常によくわかったのでそう言う意味ではいい問題だなと思いました。シンプルゆえに強い。まいん先生の問題集きぼんぬ。ああ、そういえばあゆのモノマネするの忘れてた。(tadasu)
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