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#79 The Wizard of Fz
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Broadの齋藤諒さん再登場。真核生物ゲノムにコードされたFanzorがRNAで標的をプログラム可能なエンドヌクレアーゼであることを示した論文、競合、ジョブハント、来年１月から理研で主宰予定のラボ運営方針について伺いました (8/31収録)
Show Notes (番組HP):
- 齋藤さん過去回 1 2
- 齋藤ラボ理研ECLページでの紹介
- 齋藤ラボ公募ページ（研究員・特別研究員）
- 齋藤ラボ公募ページ（パートタイマー・アルバイト）
- 理研 和光キャンパス 開拓研究本部
- トークしたイベント
- 濡木先生
- 西増先生
- 井上梓先生
- 古館昌平さんの回 1 2
論文パート
- Fanzor論文
- 最近のCell論文
- Feng Zhangラボ
- Cas9ゲノム編集論文
- Cas9ゲノム編集＠ヒト細胞 1 2
- Cas12
- Cas13
- Cas9祖先トランスポゾン論文
- Eugene Koonin
- OMEGA論文
- CASTホーミングについての齋藤さん前報
- 平野清一さんのIsrB構造論文
- ゲノム編集で病気も治るようになってきた
- トマトでGABAを増やす
- 魚で白身を増やす
- Jennifer Doudna達のFz論文
- IS (Insertion Sequence)：転移に最低限必要な酵素のみを内部にコードするトランスポゾンの一種。それぞれ番号がついていて、転移機構も色々。
- IS200/IS605
- IS607
- 2013年のFanzor命名論文
- AlphaFold
- Omar Abudayyeh（おまー）
- Jonathan Gootenberg（ぐーばー）
- 合同ラボ
- BioRxivのプレプリントHERMES
- Samuel Sternberg
- のHERMESイジり
- Science Advances論文
- TnpBのペーパー
- Virginijus Siksnys
- Kavli賞
- Soumya
- Han
- 毛みたいなほわっとしたカビ
- ATCC
- ツボカビSpizellomyces punctatus
- 濡木先生とSiksnysのTnpBの構造論文 1 2
- 末端配列とガイドRNA(ωRNA)配列の関係：これのc
- Spuのめっちゃ綺麗な末端配列：これのa
- ツボカビにも一応エレクトロポレーションはある
- PAM(Protospacer Adjacent Motif)：CRISPR-Casシステムにおいて、Cas9などのエフェクターがDNA切断を行う際に、標的配列の隣に必要とするモチーフ。SpCas9では3’側にNGG。
- TAM(Target-Adjacent Motif)：OMEGAシステムには“Protospacer”という概念が存在しないため、このように呼ぶ。
- TAM、トランスポゾン、ガイドとなっている：これのa
- Peel-and-paste：これのb
- Sam SternbergのSelfish Spreadの論文（機構はFig. 5g）
- 転写因子(TnpB様の転写抑制因子)の論文
- OMEGAのペーパーが出た時のNews and Views
- Robert Desimone
- RSIの成果報告会で受賞したのが公表されたページ
- CSHLのCRISPR Meeting
- HanのTnpBのペーパー
- CRISPR nuclease-protease
- 加藤一希先生
- Jonathan StreckerとEsraのCRISPR associated endopeptidase論文
- StreckerのCAST論文
- Peiyu Xu
- Guilhem Faure
- COVID-19で一緒に働いた
- Julia Joungの転写因子アトラス
- Max WilkinsonのR2論文
- R2レトロトランスポゾンのレビュー
- R2を使った挿入ツール 1 2
- David Liu
- David LiuのtwinPE
- Omar + Goober のPASTE
- PASTEを基盤技術にしたTome Bioscienceの最近の動向
- Jonathan Weissman
- Cas活性のパラメータについての仕事の一例
- 登さん
- Deliveryの話、例えばコレ
- 昔のラボメンはK99取ってた
- マイキーのPEG10
ジョブハントパート
- 小関先生
- 医科研のUTOPIA
- 早稲田にいた時の自分の指導教官
- UTOPIAについて一応調べた（100日でワクチン開発でした。。。 by齋藤）
- 東大の真下先生
- Cas3の論文
- 五神真先生
- 大阪大学の蛋白質研究所
- 定量研と卓越研究員制度
- 今年は加藤セチプログラムのみ
- Max君は本当にすごい
- Rockefellerインタビュー6人中2人がうちのラボ
- Kalli
- Helen Hay Whitney
- Hanna Gray
- Aviv Regev
- Xiaowei Zhuang
- Adam Cohen
- マイキーのラボ
- Max Wilkinsonの出身ラボ
- Kalliの出身ラボ
独立後の計画
- Joshua Weinstein
- DNA Microscopy
- Patrick Hsu
- Bridge RNA
- 宮脇さんが有識者の回
- 有識者会議
- 科研費倍増への運動
- 後藤由希子先生
- Kendall
- スイスで会ったギタリストの友達
- 本田圭佑
- HFSPミーティング
- 長田重一先生
- アポトーシスの写真
- 二階堂先生 ありがとうございました、引き続きよろしくお願いいたします！（by齋藤）
- 加藤英明先生 ありがとうございました、引き続きよろしくお願いいたします！（by齋藤）
- 奥山先生 ありがとうございました、引き続きよろしくお願いいたします！（by齋藤）
- Susan Gasser
- Patrick Matthias
- アセチル化やってた論文
- 吉田稔先生
- 古細菌テーマ＠HFSP
- 二段階になったHFSPフェローシップ申請（このReview Procedureタブを参照。Letters of IntentとFull Proposals）
- Yi Zhang
- 小嶋さん
- 寺坂さん
- 松田真弥さん
- 松本さん
- 古館さんのNature論文
- 長井淳さん 飲みましょう！！！（by齋藤）
- 齋藤さんMITのアドレス
Editorial Notes:
- 夢をみることができなければ、未来を変えることはできません。— 華麗なる一族（TBSテレビ, 原作・山崎豊子, 2007）（齋藤）
- 理研の現地インタビューも茶髪で乗り込んだのかどうか気になる (萩原)
- Shownotes大量に補足いただき大感謝です。今回もエナジェティックで非常に刺激を受けました、また是非！ (宮脇)
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